1995年9月14日，九寨沟加入了中国人与生物圈保护区网络，并列入世界人与生物圈保护区推荐名录。 1997年10月29日，九寨沟加入世界生物圈保护区网络，成为联合国教科文组织发起的关于人与环境关系全球性科学计划的内容之一。 1998年5月26日，联合国教科文组织和中科院为九寨沟自然保护区颁发了"世界生物圈保护区"证书。同年11月7日，成立了以州、县领导为主的九寨沟管理委员会。 2000年3月，根据国家林业局林护发（2000）131号文要求，"九寨沟国家级自然保护区管理处"更名为"九寨沟国家级自然保护区管理局"。同年10月，升格为州政府直属的正县级事业单位，实行"以州为主，州县共管"的管理体制。 2001年2月12日，九寨沟通过"绿色环球'21"初步认证。绿色环球组织亚洲总部设在澳大利亚，吸收在环境保护和生态旅游方面有突出成绩的旅游目的地和旅游企业加入该组织，并作为最佳旅游目的地和最佳旅游企业向全世界的旅游者推荐。2002年6月20日，专家组对九寨沟进行了正式评审。 [4] 2017年8月8日21时19分46秒在四川省北部阿坝州九寨沟县发生7.0级地震，震中位于九寨沟核心景区西部5公里处比芒村。 2018年3月8日起，九寨沟景区部份景观将恢复开放。开放区域为九寨沟景区沟口至长海段沿途景观，实行专车专导，团队游览方式。 [5] 2019年9月27日，经四川省政府批准，因地震和泥石流关闭的九寨沟景区准备试开园。 [2] 9月26日晚，九寨沟重新开园后的第一批游客抵达景区附近的酒店。据悉，为确保旅游服务保障满足开园要求，在食宿保障方面，九寨沟县还制定了涉旅企业、个体准入审核清单，对九寨沟景区核心区域酒店、饭店进行全覆盖审核准入，预计200余家餐馆饭店能够正常营业，宾馆酒店可提供床位超1万余张。
