1949年10月24日,新中国成立的第24天,人民解放军28军下属三个团共九千余人渡海进攻金门,在叶飞主导的指挥体系指挥下发起金门战役,在岛上苦战三昼夜,因后援不继,损失惨重,败退。
1958年,中央决定炮击金门,主席仍点将叶飞将军指挥。其时叶飞已任福建省委书记,福州军区司令员职由韩先楚将军接任。由于叶飞将军指挥得当,金门炮战第一天就击毙了国民党3位金门防卫副司令赵家骧、章杰、吉星文,击伤金门防卫司令官胡琏和台湾国防部长俞大维,一洗49年金门战役失败的耻辱。
叶飞将军成为了福州军区司令员后,他远在菲律宾的亲属听到消息,写信给叶飞将军要求帮助。当时叶飞将军的工资并不高,还要养育一大家子人,因此只汇回了一小点钱,并拒绝了要求安排工作的请求。菲律宾的亲人不了解当时的情况,认为叶飞将军是看不起穷亲戚,就和叶飞将军断绝了来往。